Arbeitszeugnis Forum

Verfügt über eine sehr gute Auffassungsgabe, die es ihm ermöglicht Abläufe logisch aufzubauen.

Das ist eine Bewertung der Arbeitsbefähigung, dem zweiten von insgesamt acht Abschnitten der Leistungsbewertung. Klingt ja erstmal "sehr gut". Ich versteh zwar nicht ganz, wie man Abläufe aufbauen kann, aber ich kenn auch deinen Beruf nicht. Ist immer schwer zu sagen, wenn man nur einen Satz sieht. Alle Abschnitte mit den jeweiligen Attributen (zur Befähigung gehört noch Organisationsvermögen, Flexibilität, Belastbarkeit usw) siehst du in der Übersicht in der Checkliste, siehe Link ganz oben. 

Die Zusammenarbeit wird von Vorgesetzten und Mitarbeitern immer positiv beurteilt.

Das gehört zum Verhaltensteil. Überlicherweise heißt es "Das Verhalten gegenüber Vorgesetzten und Mitarbeitern ist immer einwandfrei/vorbildlich".
Dass es nicht "negativ" ist, sollte ja selbstverständlich sein. Wenn das Zeugnis ansonsten gut und vollständig ist, halte ich die zwei Sätze zumindest nicht für schädlich.